Sin embargo, en la competición doméstica, el club acaba relegado a la séptima plaza del campeonato, camisetas futbol baratas por lo que finalmente solo consigue clasificarse para la Copa Intertoto. Se disputó a doble partido, el primero el 15 de junio en el Estadio de Chamartín y el segundo el 22 de junio en el Estadio de Vallecas, lugar donde jugaba temporalmente el Club Atlético-Aviación que finalizó como campeón tras perder 1-0 fuera y ganar 3-0 en casa. El sueño de la final fue frustrado por el Arsenal F. C. que eliminó al «submarino» en semifinales tras la victoria del Arsenal en la ida, camisetas fútbol (1-0 en Highbury) y empatar sin goles la vuelta en El Madrigal (encuentro que pasó a la historia por el agónico penalti que Juan Román Riquelme falló en el descuento del partido).